يكرس هذا القسم جهوده بشكل كامل لتوفير أفضل الحلول لمعالجة المياه وإدارة مياه الصرف الصحي، وتقوم دائرة معالجة المياه في إنتركول (دبليو تي دي) بتمثيل بعض من الشركات العالمية الرائدة في مجال معالجة المياه والمواد الكيميائية المتخصصة مثل: كوليغان، أدفانسد واترتيك وأكوازور نالكو وأل تي أتش أليكترونكس وبالينتيست.

و هذه الدائرة معروفة بتزويدها لتقنية تنقية المياه بواسطة طريقة التناضح العكسي للعديد من المشاريع البارزة في المملكة. ولذلك فقد إكتسبت انتركول ودائرة معالجة المياه التابعة لها سمعة طيبة لتقديمها تقنيات معالجة المياه إضافة الى الخدمات المتميزة التي توفرها لزبائنها.

وتنجز إنتركول حالياً مجموعة من المشاريع رفيعة المستوى في مملكة البحرين، حيث تقوم بأعمال التصميم والتركيب للعديد من المصانع والمؤسسات المالية والمستشفيات والفنادق ومزارع الدواجن والمنشآت الصناعية والمجمعات السكنية وغيرها.